方法基准
MAGE-A4
利用公开实验结构,开展候选设计与多模型比较。

细胞把蛋白片段呈递在HLA上,TCR需要识别这个组合。
有计算依据、来源清楚,值得进一步实验评价的研究候选。
平台如何工作
先明确目标,再提出候选;公开序列预筛放在结构计算之前,最终把候选和证据一起交给后续验证。
展开步骤,了解各环节关注的问题。
明确靶点、短肽与HLA背景。
核对抗原呈递证据与肽–HLA结构。
在研究约束下探索成对序列。
先检查序列合法性与公开专利近邻,再进入结构比较。
比较候选接触、碰撞与模型分歧。
整理候选、支持证据与后续实验需要回答的问题。
已用于不同研究环节的工具包括ProteinMPNN、TCRDiff、tFold-TCR、TCRmodel2、MHCflurry、PMGen及PRODIGY。平台工作集中于流程集成、规则管理和证据追溯;工具和数据的使用遵循相应许可。
已开展的计算研究
方法基准
利用公开实验结构,开展候选设计与多模型比较。
跨靶点研究
开展候选筛选、参考信息隔离与封存后比较。
突变表位探索
开展专利优先筛查,并评估候选结构与多样性。
应用探索
形成小规模研究候选面板,供后续验证讨论。
寻找研究伙伴
已有靶点、已有TCR,或能够开展实验验证,都可以先从一个明确的小规模研究问题开始。
寻找研究伙伴
您的靶点是什么?已有怎样的数据?希望通过实验回答什么?欢迎交流研究需求,具体研究范围、分工和成果权益另行约定。
初次交流提供研究概况即可,保密资料在确认适当安排后通过约定渠道沟通。